為培養從事醫藥、衛生、保健、永續環境等健康科學專業人才，本校於民國五十三年由創辦人王趁先生結合醫藥界與教育
界先進籌創「私立嘉南藥學專科學校」。民國五十五年奉教育部核准立案。民國八十五年七月因辦學績效卓越，獲准升格
改制為「嘉南藥理學院」，民國八十九年八月又因各項條件俱優，復獲准改名「嘉南藥理科技大學」。

　　近年來接受教育部評鑑均有極優異之表現，98至101年度連續獲得教育部技職校院獎勵大學教學卓越計畫補助。2011年
1月公佈之「世界大學網路排名」，本校名列全球第848名，全國科技大學排名第6名。而在2010年12月「機構典藏」的世界
排名中，本校名列亞洲第76名，其中「學術論文」指標更居全國科技大學之冠。

　　目前本校設有研究所、四年制及二年制等學制，分別設置藥理、民生、人文社會、健康暨資訊、環境永續、休閒等六
大學院，共計二十三個系所及九個研究所碩士班，學生人數超過一萬七千人。